👀Модель доступна на https://lysomodel.mipt.ru/ — ее можно запустить и посмотреть, что будет с pH, концентрациями ионов, трансмембранным потенциалом лизосомы, если выключить протонную помпу или нарушить проницаемость мембраны.
🎙София Назарова, студентка кафедры биофизики нашей Физтех-школы, первый автор работы, рассказывает: «По сути, основная работа заключалась в функциональном и математическом описании работы белков, обеспечивающих активный транспорт ионов. Конечно, невозможно учесть все факторы, влияющие на их работу, но мы постарались собрать максимум информации и объединить ее в строгую математическую модель.
В предыдущих моделях оставались неразрешенными несколько принципиальных вопросов. Какой транспортер поддерживает высокую концентрацию натрия в лизосоме? А кальция? Уже на финальном этапе работы над публикацией мы обнаружили, что только что вышли две статьи, в которых наконец нашли белок, отвечающий за наполнение лизосомы кальцием — TMEM165. Мы включили параметры работы этого транспортера в модель, что уточнило ее и сделало по-настоящему современной. Это поможет расширить понимание работы лизосом и ускорить ее изучение».
📎Подробности о работе ученых — в статье журнала «За науку».
📎Исследование опубликовано в Journal of General Physiology.